男性不育的發病原因復雜，許多疾病和因素可能導致男性不育。男性不育癥的原因總結如下:
1、染色體異常。常見的有男假兩性畸形、克氏綜合癥和XYY綜合癥。
2、內分泌疾病。原因是促性腺激素不足。常見的有選擇性促性腺功能低下型性機能減退，即Kallmann氏綜合征;選擇性LH缺陷癥和FSH缺陷癥;腎上腺皮質增生癥;高泌乳素血癥等。
3、生殖道感染較為常見。近年來隨著性傳播疾病發病率的提高，生殖道炎癥如前列腺炎、附睪炎、睪丸炎、尿道炎的發病率和嚴重程度有所增加，嚴重影響男性的生育能力。
4、輸精管道梗阻。影響精子的運輸。
5、睪丸生精功能異常。睪丸、精索靜脈曲張、毒素、磁場、高熱、外傷等理化因素常見，可引起睪丸生精障礙。
6、精子結構異常和精漿異常。影響精子的運動、獲得能力、頂體反應等。
7、免疫性不孕。男性自身產生的抗精子免疫和女性產生的抗精子同樣的免疫可導致男性不育。
8、男性性功能障礙。陽痿、早泄、不射精、逆行射精可引起男性不育。
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